La integración de las nuevas tecnologías
La genómica

 Una revolución tecnológica

Como complemento de los datos utilizados en las evaluaciones clásicas (genealogías y producciones), la selección genómica valoriza las informaciones provenientes del análisis del ADN obtenidas gracias a las nuevas tecnologías de genotipado (cartografía del ADN).

Los avances de la genómica no implica manipulación genética: no se modifican los animales evaluados ni su potencial genético. La genómica ofrece “solamente” una nueva herramienta particularmente eficaz para evaluar el nivel genético de los animales.

Gracias a estos progresos, resulta posible evaluar un reproductor desde su juventud más temprana, sin esperar a que su progenie haya comenzado a producir.

La selección genómica permite de este modo aumentar fuertemente el progreso genético anual. Pero sobre todo, abre nuevas perspectivas con una indexación más precisa sobre los caracteres funcionales (fertilidad, resistencia a las mastitis, facilidad de nacimiento, etc.).

En el ámbito de la mejora genética, la selección genómica representa el salto tecnológico más importante desde hace más de 40 años.

Photo en pleine largeur : Graf 1

 El tamaño determinante de las poblaciones de referencia

La primera etapa indispensable para la evaluación genómica de los reproductores de una raza es constituir una población de referencia: un conjunto de animales de esta raza, a la vez genotipados y evaluados en base a prueba de progenie.

Esta población permite analizar las relaciones genotipo/resultados de control de producción. Gracias a modelos matemáticos, se establecen relaciones estadísticas entre los resultados de genotipado y los índices calculados según los resultados de las pruebas de progenie.

La eficacia de estas fórmulas de predicción de los valores genéticos a partir de un genotipado depende en primer lugar del número de animales que constituyen esta población. Cuanto más grande es, más precisas son las relaciones estadísticas.

Una vez establecidas y verificadas estas fórmulas de predicción, resulta posible utilizarlas para estimar los distintos índices genéticos de un animal joven a partir de su genotipado.

Por lo tanto, esta evaluación genómica sólo puede referirse a los caracteres evaluados mediante prueba de progenie. La renovación de la población de referencia, con la evaluación de nuevos animales cada año en base a pruebas de progenie, sigue siendo necesaria para optimizar las fórmulas de predicción.

La evaluación genómica es de este modo eficaz si es alimentada regularmente por una información abundante (tamaño de la población de referencia) y renovada (actualización de esta población).

 Del animal a sus índices genómicos : las etapas en 10 fotografías

Recolección

La sangre representa un 99% de las muestras de tejidos recolectadas (1). Cada una de ellas es identificada por un código de barras con el fin de garantizar la trazabilidad total a lo largo del proceso (2).

Cada tubo contiene 6 ml de sangre, en lugar de 4 ml para los análisis clásicos, con el fin de poder garantizar la conservación a largo plazo de material genético testigo.

Extracción del ADN

Se requiere de cinco días para el conjunto del proceso de análisis de las muestras (3) por LABOGENA, laboratorio nacional de análisis genético para las especies animales.

El conjunto de la cadena de análisis es robotizado y pilotado por sistema informático. La primera fase consiste en la extracción del ADN (4). La cantidad requerida es quince veces más importante que para los análisis clásicos.

Preparación del ADN

El ADN extraído es recuperado y distribuido por el robot TECAN en placas que incluyen 96 pozos, es decir 96 ADN de animales diferentes (5).

Añade en cada uno de ellos los reactivos necesarios para la desnaturalización del ADN (6). Luego cada placa se coloca sobre un agitador para mezclar reactivos y ADN.

Lectura de los marcadores genéticos

Tras la centrifugación (7), incubación final (24 horas a 37°C) y fragmentación del ADN, las muestras se distribuyen sobre un chip Illumina (8).

La adición de reactivos fluorescentes permite entonces la lectura por escáner de los marcadores genéticos de cada ADN.

Análisis y cálculo de los índices genéticos

Mediante el Sistema nacional de información genética (9), los resultados se transmiten al INRA. El cálculo de los índices genómicos se realiza bajo la responsabilidad del INRA, con el apoyo de los genetistas de la UNCEIA y del Institut de l’Elevage.

Sobre la base de los resultados de estos calculos, las empresas de selección que han proporcionado las muestras eligen los toros elegidos para ser difundidos (10).